新型农村合作医疗存在的问题：一是宣传没有做到家喻户晓，农民心存顾虑；二是筹集机制不健全，村干部、医生垫资现象严重；三是农民反映合管中心兑现政策不力；四是长期生病又不适合住院治疗的参合慢性病人享受不到真正的实惠；五是部分定点医疗机构的服务能力和服务水平较低，不能满足农民看病就医需求。

    建议：一是加大宣传教育，转变农民思想观念，增强健康风险、互助共济和忧患意识；二是对农村人口进行祥细清理整顿，科学、合理下达筹资任务，防止各级垫资，虚拟提高参合率，避免产生新的债务和矛盾；三是进一步改进和完善新农合的具体操作办法，尽可能降低起付线，提高报销比例和封顶线，加大用药目录；四是将治疗时间长、费用高、又无需或不能住院的慢性病患者，列入住院报销范围或提高门诊报销比例；五是政府加大对改善农村医疗卫生条件的投入，增加必要设施、设备，创造良好就医环境。